滅菌器的日常使用管理，對滅菌器的防腐也起著至關重要的作用，建立運行管理制度，并嚴格按照相關法律法規的要求使用，包括：（1）對于日常運行發現的缺陷，要及時委托有資質的公司進行修復，避免缺陷擴大從而造成滅菌器失效；

（2）落實使用責任制，操作人員嚴格按照規范的要求持證上崗，在每次使用中建立相應臺賬，做到誰使用誰負責的責任制。

（3）編制滅菌器的操作流程，并嚴格按照操作流程進行上崗培訓，避免滅菌器的日常使用因操作人員的個人操作水平而影響滅菌器的正常使用；

（4）建立滅菌器的設備臺賬，特別是原始資料如設計文件、產品合格證、產品質量證明文件、安裝竣工材料及使用保養說明等資料，以便后期改造維修及檢驗中做到有據可查；

（5）做好定期維護保養及日常安全檢查工作，有必要時委托有資質的公司對設備進行維護管理，并加強日常的檢查工作，對易腐蝕部位進行定期檢查，發現問題，及時處理。